Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP46P62068 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP46P62068 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms