Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms