Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GGCXP38435 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GGCXP38435 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GGCXP38435 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GGCXP38435 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GGCXP38435 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GGCXP38435 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GGCXP38435 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GGCXP38435 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms