Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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