Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA1P17302 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA1P17302 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms