Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms