Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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