Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
F13BP05160 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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F13BP05160 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F13BP05160 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F13BP05160 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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