Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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