Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB3O43889 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms