Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms