Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms