Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms