Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms