Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms