Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF24Q9UPV7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms