Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNAL1Q9UBT7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNAL1Q9UBT7 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms