Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms