Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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