Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1GALT1C1-201ENST00000304661 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP9-7-201ENST00000391354 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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