Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CHCHD7Q9BUK0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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