Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms