Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms