Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms