Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SRSF12Q8WXF0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF12Q8WXF0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms