Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCER1Q8TC90 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER1Q8TC90 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms