Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms