Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms