Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms