Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ZNF549Q6P9A3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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