Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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