Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHYHD1Q5SRE7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms