Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRMS1LQ5PSV4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms