Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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