Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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