Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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