Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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