Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms