Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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DDX39BQ13838 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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DDX39BQ13838 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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