Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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