Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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