Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms