Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms