Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms