Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HBBP68871 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
HBBP68871 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms