Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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FAM3BP58499 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FAM3BP58499 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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