Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms