Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLMP48507 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms