Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms