Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms